update

src/main.cpp

@@ -28,7 +28,7 @@ int main()
 
         //参数列表 <文件分块内存大小，单个DNA序列最长大小>("输入文件名","输出文件名",序列处理函数);
         //这个函数在src/tools/dna里面
-        dna::open_file_and_calculate<(size_t)4 * 1024 * 1024 *1024 , (size_t)5e4+5>("filteredReads.txt", "reversedSequence.txt",reverseComplement);
+        dna::open_file_and_calculate<(size_t)100 * 1024 *1024 , (size_t)5e4+5>("filteredReads.txt", "reversedSequence.txt",reverseComplement);
 
     }catch(const std::exception &e){
         zt::eprint(

src/tools/dna.hpp

@@ -127,7 +127,8 @@ namespace dna {
                         // 确保每个任务只操作属于它的独立数据
                         if (get_lines_add()) {
                             // 为每一块数据创建一个任务
-                            #pragma omp task firstprivate(start, end)
+                            #pragma omp task
+                            // #pragma omp task firstprivate(start, end)
                             {
                                 reverseComplement(start, end); // 任务内处理反转互补
                             }
@@ -135,15 +136,14 @@ namespace dna {
 
                         start_pos = end_pos + 1;
                     }
-
-                    // 等待所有任务完成
-                    #pragma omp taskwait
+                    // // 等待所有任务完成
+                    // #pragma omp taskwait
                 }
 
 
                 // while((end_pos=buf_str_v.find('\n',start_pos)) != std::string_view::npos){
                 //     if(get_lines_add()){
-                //         reverseComplement(buf.data()+start_pos, buf.data()+end_pos); //我想要这个函数并行优化
+                //         reverseComplement(buf.data()+start_pos, buf.data()+end_pos); //这个函数并行优化
                 //     }
                 //     // lines=!lines;
                 //     start_pos=end_pos+1;