Zengtudor/DNASequence
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Zengtudor 2024-09-20 09:40:19 +08:00
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@ -3,6 +3,13 @@
>本项目使用了OpenMP进行并行化加速，默认开启，OpenMP在C++编译器中默认都装了的，请使用较新的编译器 >本项目使用了OpenMP进行并行化加速，默认开启，OpenMP在C++编译器中默认都装了的，请使用较新的编译器
>在win平台上似乎无法使用mingw对OpenMP加速，但是Visual Studio（MSVC） 和 Clang 在win平台上都是可以编译的 >在win平台上似乎无法使用mingw对OpenMP加速，但是Visual Studio（MSVC） 和 Clang 在win平台上都是可以编译的
>不要使用Mingw编译，win上可以使用Clang,VS(MSVC)，linux上使用gcc(g++)即可 >不要使用Mingw编译，win上可以使用Clang,VS(MSVC)，linux上使用gcc(g++)即可
## 块内存大小
```cpp
//原理是这里定义处理函数，将函数传入dna::open_file_and_calculate，在open_file_and_calculate中会调用传入的函数
//参数列表 <文件分块内存大小，单个DNA序列最长大小>("输入文件名","输出文件名",序列处理函数);
//这个函数在src/tools/dna里面
dna::open_file_and_calculate<(size_t)4 * 1024 * 1024 *1024 , (size_t)5e4+5>("filteredReads.txt", "reversedSequence.txt",reverseComplement);
```
## ***请详细阅读xmake.lua项目配置文件，可能涉及到性能优化和计算精度的问题*** ## ***请详细阅读xmake.lua项目配置文件，可能涉及到性能优化和计算精度的问题***
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